Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Urb2E9Q7L1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Urb2E9Q7L1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Urb2E9Q7L1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Urb2E9Q7L1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Urb2E9Q7L1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Urb2E9Q7L1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Urb2E9Q7L1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Urb2E9Q7L1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Urb2E9Q7L1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Urb2E9Q7L1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Urb2E9Q7L1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Urb2E9Q7L1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Urb2E9Q7L1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Urb2E9Q7L1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Urb2E9Q7L1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Urb2E9Q7L1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Urb2E9Q7L1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Urb2E9Q7L1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Urb2E9Q7L1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Urb2E9Q7L1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Urb2E9Q7L1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Urb2E9Q7L1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Urb2E9Q7L1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Urb2E9Q7L1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Urb2E9Q7L1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Urb2E9Q7L1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Urb2E9Q7L1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Urb2E9Q7L1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Urb2E9Q7L1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Urb2E9Q7L1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
Urb2E9Q7L1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Urb2E9Q7L1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Urb2E9Q7L1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Urb2E9Q7L1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Urb2E9Q7L1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Urb2E9Q7L1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Urb2E9Q7L1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Urb2E9Q7L1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Urb2E9Q7L1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Urb2E9Q7L1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
Urb2E9Q7L1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Urb2E9Q7L1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Urb2E9Q7L1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Urb2E9Q7L1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Urb2E9Q7L1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Urb2E9Q7L1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Urb2E9Q7L1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Urb2E9Q7L1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Urb2E9Q7L1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Urb2E9Q7L1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Urb2E9Q7L1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Urb2E9Q7L1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Urb2E9Q7L1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Urb2E9Q7L1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Urb2E9Q7L1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Urb2E9Q7L1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Urb2E9Q7L1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Urb2E9Q7L1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Urb2E9Q7L1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Urb2E9Q7L1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Urb2E9Q7L1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Urb2E9Q7L1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Urb2E9Q7L1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Urb2E9Q7L1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Urb2E9Q7L1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Urb2E9Q7L1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Urb2E9Q7L1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Urb2E9Q7L1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Urb2E9Q7L1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Urb2E9Q7L1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Urb2E9Q7L1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Urb2E9Q7L1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Urb2E9Q7L1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Urb2E9Q7L1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Urb2E9Q7L1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.3 ms