Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp31E9Q6Y8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp31E9Q6Y8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp31E9Q6Y8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp31E9Q6Y8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp31E9Q6Y8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms