Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UtrnE9Q6R7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UtrnE9Q6R7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UtrnE9Q6R7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
UtrnE9Q6R7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
UtrnE9Q6R7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
UtrnE9Q6R7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UtrnE9Q6R7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UtrnE9Q6R7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UtrnE9Q6R7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UtrnE9Q6R7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UtrnE9Q6R7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UtrnE9Q6R7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UtrnE9Q6R7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
UtrnE9Q6R7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UtrnE9Q6R7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UtrnE9Q6R7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UtrnE9Q6R7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UtrnE9Q6R7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UtrnE9Q6R7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UtrnE9Q6R7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms