Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nolc1E9Q5C9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nolc1E9Q5C9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nolc1E9Q5C9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nolc1E9Q5C9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nolc1E9Q5C9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nolc1E9Q5C9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nolc1E9Q5C9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nolc1E9Q5C9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nolc1E9Q5C9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nolc1E9Q5C9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nolc1E9Q5C9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nolc1E9Q5C9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nolc1E9Q5C9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nolc1E9Q5C9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nolc1E9Q5C9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nolc1E9Q5C9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nolc1E9Q5C9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nolc1E9Q5C9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nolc1E9Q5C9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nolc1E9Q5C9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nolc1E9Q5C9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nolc1E9Q5C9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms