Protein–RNA interactions for Protein: E9Q501

Gm2237, Predicted gene 2237, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2237E9Q501 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm2237E9Q501 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm2237E9Q501 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2237E9Q501 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm2237E9Q501 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms