Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrp3E9Q1T6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Lrp3E9Q1T6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrp3E9Q1T6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrp3E9Q1T6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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