Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Rsf1E9PWW9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Rsf1E9PWW9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Rsf1E9PWW9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Rsf1E9PWW9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Rsf1E9PWW9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Rsf1E9PWW9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Rsf1E9PWW9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Rsf1E9PWW9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
Rsf1E9PWW9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Rsf1E9PWW9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Rsf1E9PWW9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Rsf1E9PWW9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Rsf1E9PWW9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Rsf1E9PWW9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Rsf1E9PWW9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Rsf1E9PWW9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Rsf1E9PWW9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Rsf1E9PWW9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Rsf1E9PWW9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Rsf1E9PWW9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Rsf1E9PWW9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Rsf1E9PWW9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Rsf1E9PWW9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Rsf1E9PWW9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Rsf1E9PWW9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Rsf1E9PWW9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Rsf1E9PWW9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Rsf1E9PWW9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Rsf1E9PWW9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Rsf1E9PWW9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Rsf1E9PWW9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
Rsf1E9PWW9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Rsf1E9PWW9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Rsf1E9PWW9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Rsf1E9PWW9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Rsf1E9PWW9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Rsf1E9PWW9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Rsf1E9PWW9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Rsf1E9PWW9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Rsf1E9PWW9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Rsf1E9PWW9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Rsf1E9PWW9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Rsf1E9PWW9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Rsf1E9PWW9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Rsf1E9PWW9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Rsf1E9PWW9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Rsf1E9PWW9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Rsf1E9PWW9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Rsf1E9PWW9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Rsf1E9PWW9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Rsf1E9PWW9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Rsf1E9PWW9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Rsf1E9PWW9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Rsf1E9PWW9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Rsf1E9PWW9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Rsf1E9PWW9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Rsf1E9PWW9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Rsf1E9PWW9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Rsf1E9PWW9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Rsf1E9PWW9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Rsf1E9PWW9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Rsf1E9PWW9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Rsf1E9PWW9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Rsf1E9PWW9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Rsf1E9PWW9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rsf1E9PWW9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rsf1E9PWW9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Rsf1E9PWW9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Rsf1E9PWW9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Rsf1E9PWW9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Rsf1E9PWW9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Rsf1E9PWW9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Rsf1E9PWW9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Rsf1E9PWW9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Rsf1E9PWW9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Rsf1E9PWW9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Rsf1E9PWW9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Rsf1E9PWW9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Rsf1E9PWW9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rsf1E9PWW9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rsf1E9PWW9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rsf1E9PWW9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rsf1E9PWW9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rsf1E9PWW9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rsf1E9PWW9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Rsf1E9PWW9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Rsf1E9PWW9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Rsf1E9PWW9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Rsf1E9PWW9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Rsf1E9PWW9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
Rsf1E9PWW9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rsf1E9PWW9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rsf1E9PWW9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rsf1E9PWW9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rsf1E9PWW9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Rsf1E9PWW9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Rsf1E9PWW9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Rsf1E9PWW9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Rsf1E9PWW9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms