Protein–RNA interactions for Protein: E9PV87

Talpid3, Protein TALPID3, mousemouse

Predictions only

Length 1,520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Talpid3E9PV87 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Talpid3E9PV87 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Talpid3E9PV87 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Talpid3E9PV87 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Talpid3E9PV87 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Talpid3E9PV87 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Talpid3E9PV87 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Talpid3E9PV87 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Talpid3E9PV87 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
Talpid3E9PV87 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Talpid3E9PV87 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Talpid3E9PV87 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Talpid3E9PV87 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Talpid3E9PV87 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Talpid3E9PV87 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Talpid3E9PV87 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Talpid3E9PV87 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Talpid3E9PV87 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Talpid3E9PV87 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Talpid3E9PV87 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Talpid3E9PV87 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Talpid3E9PV87 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Talpid3E9PV87 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Talpid3E9PV87 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Talpid3E9PV87 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Talpid3E9PV87 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Talpid3E9PV87 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Talpid3E9PV87 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Talpid3E9PV87 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Talpid3E9PV87 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Talpid3E9PV87 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Talpid3E9PV87 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Talpid3E9PV87 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Talpid3E9PV87 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Talpid3E9PV87 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Talpid3E9PV87 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Talpid3E9PV87 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Talpid3E9PV87 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Talpid3E9PV87 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Talpid3E9PV87 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Talpid3E9PV87 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Talpid3E9PV87 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Talpid3E9PV87 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Talpid3E9PV87 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Talpid3E9PV87 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Talpid3E9PV87 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Talpid3E9PV87 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Talpid3E9PV87 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Talpid3E9PV87 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Talpid3E9PV87 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Talpid3E9PV87 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Talpid3E9PV87 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Talpid3E9PV87 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Talpid3E9PV87 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Talpid3E9PV87 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Talpid3E9PV87 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Talpid3E9PV87 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Talpid3E9PV87 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Talpid3E9PV87 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Talpid3E9PV87 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Talpid3E9PV87 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Talpid3E9PV87 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Talpid3E9PV87 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Talpid3E9PV87 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Talpid3E9PV87 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Talpid3E9PV87 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Talpid3E9PV87 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Talpid3E9PV87 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Talpid3E9PV87 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Talpid3E9PV87 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Talpid3E9PV87 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Talpid3E9PV87 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Talpid3E9PV87 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Talpid3E9PV87 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Talpid3E9PV87 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Talpid3E9PV87 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Talpid3E9PV87 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Talpid3E9PV87 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Talpid3E9PV87 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms