Protein–RNA interactions for Protein: E9PUT9

Gm3252, Predicted gene 3252, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3252E9PUT9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3252E9PUT9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3252E9PUT9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3252E9PUT9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3252E9PUT9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3252E9PUT9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3252E9PUT9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3252E9PUT9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3252E9PUT9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3252E9PUT9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm3252E9PUT9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm3252E9PUT9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3252E9PUT9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3252E9PUT9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3252E9PUT9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3252E9PUT9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3252E9PUT9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3252E9PUT9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3252E9PUT9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3252E9PUT9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3252E9PUT9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3252E9PUT9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms