Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Soga1E1U8D0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Soga1E1U8D0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Soga1E1U8D0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Soga1E1U8D0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Soga1E1U8D0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Soga1E1U8D0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Soga1E1U8D0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Soga1E1U8D0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Soga1E1U8D0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Soga1E1U8D0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Soga1E1U8D0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Soga1E1U8D0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Soga1E1U8D0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Soga1E1U8D0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Soga1E1U8D0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Soga1E1U8D0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Soga1E1U8D0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Soga1E1U8D0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Soga1E1U8D0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Soga1E1U8D0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Soga1E1U8D0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Soga1E1U8D0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Soga1E1U8D0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Soga1E1U8D0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Soga1E1U8D0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Soga1E1U8D0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Soga1E1U8D0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Soga1E1U8D0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Soga1E1U8D0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Soga1E1U8D0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Soga1E1U8D0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Soga1E1U8D0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Soga1E1U8D0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Soga1E1U8D0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Soga1E1U8D0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Soga1E1U8D0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Soga1E1U8D0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Soga1E1U8D0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Soga1E1U8D0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Soga1E1U8D0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
Soga1E1U8D0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Soga1E1U8D0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Soga1E1U8D0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Soga1E1U8D0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Soga1E1U8D0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Soga1E1U8D0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Soga1E1U8D0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Soga1E1U8D0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Soga1E1U8D0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Soga1E1U8D0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Soga1E1U8D0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Soga1E1U8D0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Soga1E1U8D0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Soga1E1U8D0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Soga1E1U8D0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Soga1E1U8D0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Soga1E1U8D0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Soga1E1U8D0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Soga1E1U8D0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Soga1E1U8D0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Soga1E1U8D0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Soga1E1U8D0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Soga1E1U8D0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Soga1E1U8D0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Soga1E1U8D0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Soga1E1U8D0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Soga1E1U8D0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Soga1E1U8D0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Soga1E1U8D0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Soga1E1U8D0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Soga1E1U8D0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Soga1E1U8D0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Soga1E1U8D0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Soga1E1U8D0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Soga1E1U8D0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Soga1E1U8D0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Soga1E1U8D0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Soga1E1U8D0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Soga1E1U8D0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Soga1E1U8D0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms