Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
1110002E22RikE0CYV9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
1110002E22RikE0CYV9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
1110002E22RikE0CYV9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
1110002E22RikE0CYV9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
1110002E22RikE0CYV9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1110002E22RikE0CYV9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1110002E22RikE0CYV9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1110002E22RikE0CYV9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
1110002E22RikE0CYV9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1110002E22RikE0CYV9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
1110002E22RikE0CYV9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1110002E22RikE0CYV9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
1110002E22RikE0CYV9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1110002E22RikE0CYV9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1110002E22RikE0CYV9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1110002E22RikE0CYV9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1110002E22RikE0CYV9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
1110002E22RikE0CYV9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1110002E22RikE0CYV9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
1110002E22RikE0CYV9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
1110002E22RikE0CYV9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
1110002E22RikE0CYV9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
1110002E22RikE0CYV9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms