Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptprz1B9EKR1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ptprz1B9EKR1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptprz1B9EKR1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms