Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nxpe3B9EKK6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nxpe3B9EKK6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nxpe3B9EKK6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nxpe3B9EKK6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms