Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf11bB4XVQ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Phf11bB4XVQ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Phf11bB4XVQ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phf11bB4XVQ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Phf11bB4XVQ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf11bB4XVQ1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
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