Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp42B2RQC2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp42B2RQC2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp42B2RQC2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp42B2RQC2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp42B2RQC2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp42B2RQC2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp42B2RQC2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp42B2RQC2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp42B2RQC2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp42B2RQC2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp42B2RQC2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp42B2RQC2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp42B2RQC2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp42B2RQC2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp42B2RQC2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp42B2RQC2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp42B2RQC2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp42B2RQC2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp42B2RQC2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp42B2RQC2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp42B2RQC2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp42B2RQC2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp42B2RQC2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms