Protein–RNA interactions for Protein: B1AVN5

Zfp990, Zinc finger protein 990, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp990B1AVN5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp990B1AVN5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp990B1AVN5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zfp990B1AVN5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp990B1AVN5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp990B1AVN5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp990B1AVN5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp990B1AVN5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp990B1AVN5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp990B1AVN5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp990B1AVN5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp990B1AVN5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms