Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NhsB1AV60 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NhsB1AV60 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NhsB1AV60 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35■■■■□ 3.19
NhsB1AV60 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NhsB1AV60 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35■■■■□ 3.19
NhsB1AV60 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NhsB1AV60 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NhsB1AV60 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
NhsB1AV60 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NhsB1AV60 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
NhsB1AV60 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NhsB1AV60 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NhsB1AV60 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NhsB1AV60 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NhsB1AV60 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NhsB1AV60 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NhsB1AV60 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NhsB1AV60 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NhsB1AV60 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NhsB1AV60 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NhsB1AV60 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NhsB1AV60 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NhsB1AV60 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NhsB1AV60 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NhsB1AV60 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
NhsB1AV60 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NhsB1AV60 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NhsB1AV60 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NhsB1AV60 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NhsB1AV60 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NhsB1AV60 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NhsB1AV60 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NhsB1AV60 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NhsB1AV60 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NhsB1AV60 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NhsB1AV60 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NhsB1AV60 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NhsB1AV60 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NhsB1AV60 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
NhsB1AV60 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
NhsB1AV60 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NhsB1AV60 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NhsB1AV60 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NhsB1AV60 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NhsB1AV60 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NhsB1AV60 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NhsB1AV60 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NhsB1AV60 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
NhsB1AV60 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
NhsB1AV60 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NhsB1AV60 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NhsB1AV60 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
NhsB1AV60 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NhsB1AV60 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NhsB1AV60 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NhsB1AV60 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NhsB1AV60 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
NhsB1AV60 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NhsB1AV60 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NhsB1AV60 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NhsB1AV60 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
NhsB1AV60 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NhsB1AV60 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
NhsB1AV60 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
NhsB1AV60 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NhsB1AV60 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NhsB1AV60 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NhsB1AV60 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NhsB1AV60 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NhsB1AV60 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NhsB1AV60 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NhsB1AV60 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NhsB1AV60 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NhsB1AV60 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NhsB1AV60 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NhsB1AV60 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms