Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Herc3A6H6S0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Herc3A6H6S0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Herc3A6H6S0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms