Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtcflA2APF3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtcflA2APF3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtcflA2APF3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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