Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd60A2AMD2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ankrd60A2AMD2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ankrd60A2AMD2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ankrd60A2AMD2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ankrd60A2AMD2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ankrd60A2AMD2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd60A2AMD2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd60A2AMD2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd60A2AMD2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd60A2AMD2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd60A2AMD2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd60A2AMD2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd60A2AMD2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd60A2AMD2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd60A2AMD2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd60A2AMD2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd60A2AMD2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd60A2AMD2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd60A2AMD2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd60A2AMD2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd60A2AMD2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms