Protein–RNA interactions for Protein: A2AJK6

Chd7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd7A2AJK6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Chd7A2AJK6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd7A2AJK6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd7A2AJK6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd7A2AJK6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd7A2AJK6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms