Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm884A2A9H6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm884A2A9H6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm884A2A9H6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm884A2A9H6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms