Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef6A2A8M8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef6A2A8M8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef6A2A8M8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef6A2A8M8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef6A2A8M8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef6A2A8M8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef6A2A8M8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef6A2A8M8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef6A2A8M8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef6A2A8M8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef6A2A8M8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef6A2A8M8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef6A2A8M8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.6 ms