Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIW3

Frmpd3, FERM and PDZ domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd3A0A140LIW3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd3A0A140LIW3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd3A0A140LIW3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Frmpd3A0A140LIW3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Frmpd3A0A140LIW3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Frmpd3A0A140LIW3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Frmpd3A0A140LIW3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Frmpd3A0A140LIW3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Frmpd3A0A140LIW3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd3A0A140LIW3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd3A0A140LIW3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd3A0A140LIW3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Frmpd3A0A140LIW3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Frmpd3A0A140LIW3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Frmpd3A0A140LIW3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Frmpd3A0A140LIW3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd3A0A140LIW3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd3A0A140LIW3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd3A0A140LIW3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd3A0A140LIW3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd3A0A140LIW3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmpd3A0A140LIW3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmpd3A0A140LIW3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmpd3A0A140LIW3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Frmpd3A0A140LIW3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Frmpd3A0A140LIW3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Frmpd3A0A140LIW3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms