Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trbv2A0A0B4J1G8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv2A0A0B4J1G8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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