Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnga1P29974 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms