Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms