Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb3P09026 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms