Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms