Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edf1Q9JMG1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms