Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.1 ms