Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms