Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NipblQ6KCD5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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