Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Stk39Q9Z1W9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Stk39Q9Z1W9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stk39Q9Z1W9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stk39Q9Z1W9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stk39Q9Z1W9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stk39Q9Z1W9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stk39Q9Z1W9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Stk39Q9Z1W9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stk39Q9Z1W9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stk39Q9Z1W9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stk39Q9Z1W9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stk39Q9Z1W9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stk39Q9Z1W9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stk39Q9Z1W9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stk39Q9Z1W9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stk39Q9Z1W9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stk39Q9Z1W9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stk39Q9Z1W9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stk39Q9Z1W9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stk39Q9Z1W9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stk39Q9Z1W9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stk39Q9Z1W9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stk39Q9Z1W9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Stk39Q9Z1W9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stk39Q9Z1W9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stk39Q9Z1W9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stk39Q9Z1W9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stk39Q9Z1W9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stk39Q9Z1W9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stk39Q9Z1W9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stk39Q9Z1W9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stk39Q9Z1W9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stk39Q9Z1W9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stk39Q9Z1W9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stk39Q9Z1W9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stk39Q9Z1W9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stk39Q9Z1W9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stk39Q9Z1W9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Stk39Q9Z1W9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stk39Q9Z1W9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stk39Q9Z1W9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stk39Q9Z1W9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stk39Q9Z1W9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Stk39Q9Z1W9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stk39Q9Z1W9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stk39Q9Z1W9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stk39Q9Z1W9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stk39Q9Z1W9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stk39Q9Z1W9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stk39Q9Z1W9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms