Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carm1Q9WVG6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carm1Q9WVG6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carm1Q9WVG6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carm1Q9WVG6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carm1Q9WVG6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carm1Q9WVG6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carm1Q9WVG6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carm1Q9WVG6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carm1Q9WVG6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carm1Q9WVG6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carm1Q9WVG6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carm1Q9WVG6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carm1Q9WVG6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Carm1Q9WVG6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carm1Q9WVG6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carm1Q9WVG6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carm1Q9WVG6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carm1Q9WVG6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Carm1Q9WVG6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carm1Q9WVG6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carm1Q9WVG6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms