Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh3bgrQ9WUZ7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms