Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB0

Rbck1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbck1Q9WUB0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbck1Q9WUB0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbck1Q9WUB0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbck1Q9WUB0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms