Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkraQ9WTX2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PrkraQ9WTX2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122 ms