Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psma4Q9R1P0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psma4Q9R1P0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Psma4Q9R1P0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms