Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0W9

Chrna6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna6Q9R0W9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna6Q9R0W9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna6Q9R0W9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna6Q9R0W9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna6Q9R0W9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna6Q9R0W9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna6Q9R0W9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna6Q9R0W9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna6Q9R0W9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna6Q9R0W9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna6Q9R0W9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna6Q9R0W9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna6Q9R0W9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna6Q9R0W9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna6Q9R0W9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna6Q9R0W9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna6Q9R0W9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrna6Q9R0W9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna6Q9R0W9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna6Q9R0W9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna6Q9R0W9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms