Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col4a4Q9QZR9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a4Q9QZR9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a4Q9QZR9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a4Q9QZR9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a4Q9QZR9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col4a4Q9QZR9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col4a4Q9QZR9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a4Q9QZR9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a4Q9QZR9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a4Q9QZR9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a4Q9QZR9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col4a4Q9QZR9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col4a4Q9QZR9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a4Q9QZR9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a4Q9QZR9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a4Q9QZR9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a4Q9QZR9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a4Q9QZR9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a4Q9QZR9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col4a4Q9QZR9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Col4a4Q9QZR9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms