Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2afyQ9QZQ8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2afyQ9QZQ8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms