Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Npas3Q9QZQ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Npas3Q9QZQ0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Npas3Q9QZQ0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Npas3Q9QZQ0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Npas3Q9QZQ0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Npas3Q9QZQ0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Npas3Q9QZQ0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Npas3Q9QZQ0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Npas3Q9QZQ0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Npas3Q9QZQ0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Npas3Q9QZQ0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Npas3Q9QZQ0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Npas3Q9QZQ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Npas3Q9QZQ0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Npas3Q9QZQ0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Npas3Q9QZQ0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Npas3Q9QZQ0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Npas3Q9QZQ0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Npas3Q9QZQ0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Npas3Q9QZQ0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms