Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms