Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY6

Ehd3, EH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd3Q9QXY6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ehd3Q9QXY6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ehd3Q9QXY6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ehd3Q9QXY6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ehd3Q9QXY6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ehd3Q9QXY6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ehd3Q9QXY6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ehd3Q9QXY6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ehd3Q9QXY6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ehd3Q9QXY6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms