Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tcea2Q9QVN7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcea2Q9QVN7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcea2Q9QVN7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcea2Q9QVN7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms