Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc2lQ9JME7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc2lQ9JME7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc2lQ9JME7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc2lQ9JME7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms