Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sfmbt1Q9JMD1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms