Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctnnbip1Q9JJN6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms