Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJC9

Herpud2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud2Q9JJC9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Herpud2Q9JJC9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Herpud2Q9JJC9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Herpud2Q9JJC9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Herpud2Q9JJC9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Herpud2Q9JJC9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Herpud2Q9JJC9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Herpud2Q9JJC9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Herpud2Q9JJC9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Herpud2Q9JJC9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herpud2Q9JJC9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herpud2Q9JJC9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Herpud2Q9JJC9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Herpud2Q9JJC9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Herpud2Q9JJC9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Herpud2Q9JJC9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Herpud2Q9JJC9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Herpud2Q9JJC9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Herpud2Q9JJC9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Herpud2Q9JJC9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Herpud2Q9JJC9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Herpud2Q9JJC9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Herpud2Q9JJC9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Herpud2Q9JJC9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Herpud2Q9JJC9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herpud2Q9JJC9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herpud2Q9JJC9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herpud2Q9JJC9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Herpud2Q9JJC9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Herpud2Q9JJC9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Herpud2Q9JJC9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Herpud2Q9JJC9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herpud2Q9JJC9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Herpud2Q9JJC9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms